Khu vực được đưa vào khai thác duy nhất vào mùa nước nổi là khu A2, nơi các loài chim chọn làm nơi sinh sản.

Hiện, Tràm Chim có 231 loài đang sinh sống (chiếm ¼ tổng số loài xuất hiện tại Việt Nam), trong đó có hàng ngàn cá thể điên điển, còng cọc, cò ốc.

Ở mùa này, vào tận bãi chim sinh sản, du khách sẽ được tìm hiểu về thói quen đẻ trứng, nuôi con của các loài chim.

Tại Tràm Chim, mùa nước lên cũng là thời điểm loài chim dòng dộc (một số địa phương còn gọi là rồng rộc) làm tổ. Đây là loài chim có kiểu cách làm tổ cầu kỳ phức tạp và được mệnh danh là bậc thầy xây tổ./.