Theo quy hoạch khu Trung tâm có 2 khu vực chính gồm khu di tích lịch sử (gọi là khu đỏ) và khu vui chơi giải trí (gọi là khu xanh). Khu di tích lịch sử lại có 2 phân khu: Phân khu tái hiện căn cứ cách mạng và phân khu tái hiện các trận đánh tiêu biểu. Phân khu tái hiện căn cứ cách mạng chia làm nhiều tiểu khu: Căn cứ TƯ Cục miền Nam; Căn cứ Chính phủ Cách mạng lâm thời Cộng hoà miền Nam Việt Nam; Căn cứ Mặt trận Dân tộc giải phóng miền Nam Việt Nam; Căn cứ Bộ chỉ huy Miền; Căn cứ Tỉnh uỷ Tây Ninh; Căn cứ Bộ Chỉ huy chiến dịch Hồ Chí Minh.

Song song với việc tái tạo các khu căn cứ và các trận đánh tiêu biểu là việc tái tạo lại mảng cây xanh phù hợp đặc điểm từng nơi, nơi là vùng trảng, với các loại cây lùm, cây bụi, nơi là vùng đất cao, đất đỏ với các cây cao to, có nơi lại là vùng bưng biền với các loại cây chịu phèn, chịu mặn.

Khu vui chơi giải trí gồm các tiểu khu: Du lịch sinh thái; Nơi tổ chức các trò chơi dân gian; Tiểu khu văn hoá, lịch sử khoa học giáo dục; tiểu khu kinh doanh… Ở mỗi tiểu khu lại có các hạng mục khác nhau như: Nhà trưng bày hiện vật, hình ảnh, tư liệu lịch sử; Tái hiện hệ thống cơ sở hậu cần để trực tiếp phục vụ cho nhu cầu tác chiến; Khu vực tái tạo thu nhỏ thảm thực vật…

Ngoài “khu đỏ” và “khu xanh”, còn có khu trung tâm có hệ thống giao thông chính, quảng trường và cụm tượng đài; khu trưng bày ngoài trời và nhà bảo tàng cách mạng.

Công trình này được chia làm 3 giai đoạn xây dựng: Giai đoạn 1 từ năm 2006-2010, xây dựng cơ sở hạ tầng và trồng rừng; Giai đoạn 2 từ năm 2010-2012 xây dựng khu tái hiện lịch sử căn cứ cách mạng, khu đón tiếp, khu sinh vật cảnh; Giai đoạn 3 từ năm 2013-2018, xây dựng các khu vui chơi giải trí, bảo tàng.

Trung tâm tái hiện di tích lịch sử Cách mạng miền Nam tại Bời Lời có khả năng tạo ra sức hấp dẫn từ bởi loại hình "du lịch về nguồn” kết hợp với du lịch sinh thái. Đây còn là một khu bảo tồn thiên nhiên, là điểm hẹn của các nhà khoa học, các nhà nghiên cứu và đội ngũ học sinh, sinh viên đến tìm hiểu về văn hoá, lịch sử, nghệ thuật chiến đấu của các thế hệ đi trước đồng thời còn có thể là nơi đáp ứng nhu cầu nghiên cứu về động, thực vật.