Tuyến du lịch đường thủy Bắc Mê - Na Hang - Ba Bể đi qua 3 tỉnh Hà Giang - Tuyên Quang - Bắc Kạn, có chiều dài trên 100 km, với tổng diện tích mặt nước 35.500 ha, có độ sâu trung bình 30 - 40m, tạo nên cảnh quan đặc sắc, đa dạng, trong đó đặc trưng là cảnh quan Hồ - núi - đảo- đồi. Vành đai quanh hồ và lòng hồ có điều kiện thổ nhưỡng hết sức thuận lợi cho phát triển hệ sinh thái đa dạng từ sinh thái rừng nguyên sinh, tái sinh; sinh thái mặt nước và sinh thái nước nông, nước sâu tạo ra hệ thống thảm thực vật và hệ động vật phong phú đa dạng mang sắc thái rừng nhiệt đới, với các loại cây gỗ quý, hiếm như nghiến, trai, lim; các loại cá nước ngọt quý hiếm như cá Anh vũ, Dầm xanh. Đặc biệt, Hồ Ba Bể (Bắc Kạn) được đánh giá là một trong 20 hồ nước ngọt tự nhiên lớn và đẹp nhất thế giới, trải rộng trên 23.000 ha, trong đó có 7.000 ha thuộc vùng lõi, là nơi tập trung nhiều loại cá nước ngọt nhất cả nước với 106 loài. Đây là tiềm năng lớn để phát triển các loại hình du lịch như: Du thuyền, tham quan rừng nguyên sinh, tìm hiểu chợ nông thôn, tham quan làng văn hóa du lịch cộng đồng ở bên bờ hồ, đánh bắt các loại thủy sản, tổ chức các loại hình thể thao trên mặt nước…